নামকরণ নিয়ে গ্রন্থগত কোন ইতিহাস নাই, এলাকার গন্যমান্য ব্যক্তিবর্গের বয়সের ভারে নজ্যু এমন সুধীজনের কাছে জানা যায় যে, ব্রিটিশ শাসনামলে পঞ্চায়েত প্রথা শুরুর লগ্নে বিশালাকার পাঁচটি বটবৃক্ষের ছায়াতলে এলাকার লোকজন বিশ্রাম নিতো এবং রাত্রীকালে পুথি পড়া সহ বিভিন্ন আমোদ-প্রমোদ করতো। এমনকি এলাকার পারিবারিক সালিশী কাজও ঐ স্থানে চলতো। তাই ঐ স্থানটি পাঁচগাছী নামে জনমুখে পরিচিতি লাভ করে। পরে গাছগুলি সরকারীভাবে বিক্রি হলেও ঐ গ্রামের নাম দেয়া হয় পাঁচগাছী। কালের বিবর্তনে পঞ্চায়েত প্রথা বিলুপ্ত হওয়ার প্রাক্কালে ইউপি গঠনের শুরুতে পঞ্চায়েত প্রধানের কাছে ইউনিয়নের নাম চাওয়া হয়, তৎকালীন পঞ্চায়েত প্রধান ঐ পাঁচগাছীর স্থায়ী বাসিন্দা হওয়ায়, তিনি অত্র ইউনিয়নের নাম রাখেন পাঁচগাছী ইউনিয়ন। যাহা এখন স্থায়ী ১৬নং মির্জাপুর ইউপি-র রুপ নেয়।
পরিকল্পনা ও বাস্তবায়নে: মন্ত্রিপরিষদ বিভাগ, এটুআই, বিসিসি, ডিওআইসিটি ও বেসিস